应安装独立的送排风系统，控制消毒室的气流方向和压力梯度。在无菌室内，必须确保空气通过操作区流向排风口。送、排风口的布置应为对向分布，上送下排，以尽量减少无菌室内的空气死角和涡流。可将送排风系统采用回风系统。
无菌室的空气输送应采用初筛、中筛和高筛。无菌室外排气孔应远离送风口，设在主风向下，应具有防雨、防鼠、防虫的设计，但不影响气体直接排入上空。
高效空气过滤器应该安装在供气管道的末端。
通风系统，高效空气过滤器，必须安装牢固，并满足气密要求。高效率过滤器应在更换前消毒，或使用可在气密带袋内更换的过滤器，更换后应立即消毒或焚化。每个高效过滤器安装，更换，维护后都要对无菌室内的空气进行检测，以保证其性能。
供、排风总管处应安装气密型密封阀，必要时可完全关闭，用于室内化学熏蒸消毒。在消毒房和缓冲室内不应另装分体空调、取暖设备和电风扇等。具体要求：应确保整体通风换气不少于6次/小时。大连无菌净化
净化和通风系统由空调机组、风扇机组(包括送风机和排风机)和地面的机房组成。这些送风单元还包括：新风口、新回风混合区、送风区、均流区(编修区)、中效区、出风区和消声区。有足够的动力使空调全年室内温度保持在20-24℃内，温度不超过60%.超净台的洁净度应达到100级。
